MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b

Total Repeats: 3348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011990	GAC	2	6	56212	56217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109000
1002	NC_011990	CG	3	6	56219	56224	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
1003	NC_011990	CCG	2	6	56279	56284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1004	NC_011990	TCG	2	6	56294	56299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109000
1005	NC_011990	CG	4	8	56474	56481	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
1006	NC_011990	CCG	2	6	56538	56543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1007	NC_011990	GAA	2	6	56608	56613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109000
1008	NC_011990	GTC	2	6	56614	56619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109000
1009	NC_011990	GCGG	2	8	56620	56627	0 %	0 %	75 %	25 %	222109000
1010	NC_011990	GGCGAC	2	12	56662	56673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109000
1011	NC_011990	CGGC	2	8	56768	56775	0 %	0 %	50 %	50 %	222109000
1012	NC_011990	CGC	2	6	56838	56843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1013	NC_011990	GTC	2	6	56876	56881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109000
1014	NC_011990	CCG	2	6	56888	56893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1015	NC_011990	GAT	2	6	56918	56923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109000
1016	NC_011990	AGCAG	2	10	56940	56949	40 %	0 %	40 %	20 %	222109000
1017	NC_011990	GCC	2	6	56959	56964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1018	NC_011990	GGC	2	6	57004	57009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109000
1019	NC_011990	GCC	2	6	57077	57082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1020	NC_011990	GCC	2	6	57127	57132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1021	NC_011990	TGT	2	6	57148	57153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109000
1022	NC_011990	GGC	2	6	57160	57165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109000
1023	NC_011990	ATC	2	6	57227	57232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109000
1024	NC_011990	GGCA	2	8	57268	57275	25 %	0 %	50 %	25 %	222109000
1025	NC_011990	TGA	2	6	57327	57332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109000
1026	NC_011990	CGG	2	6	57363	57368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109000
1027	NC_011990	GCC	2	6	57494	57499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1028	NC_011990	GCT	2	6	57504	57509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109000
1029	NC_011990	CGC	2	6	57532	57537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109000
1030	NC_011990	CGG	2	6	57651	57656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109001
1031	NC_011990	CCG	2	6	57657	57662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109001
1032	NC_011990	AGC	3	9	57678	57686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109001
1033	NC_011990	T	6	6	57739	57744	0 %	100 %	0 %	0 %	222109001
1034	NC_011990	CTT	2	6	57755	57760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109001
1035	NC_011990	GCGT	2	8	57761	57768	0 %	25 %	50 %	25 %	222109001
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1038	NC_011990	CGA	2	6	58074	58079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109002
1039	NC_011990	T	6	6	58083	58088	0 %	100 %	0 %	0 %	222109002
1040	NC_011990	GGTT	2	8	58095	58102	0 %	50 %	50 %	0 %	222109002
1041	NC_011990	TCC	2	6	58142	58147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109002
1042	NC_011990	TGG	2	6	58200	58205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109002
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1045	NC_011990	CGG	3	9	58390	58398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109003
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1048	NC_011990	CG	3	6	58541	58546	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
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1054	NC_011990	CGG	2	6	58975	58980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109003
1055	NC_011990	CGA	2	6	59037	59042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109003
1056	NC_011990	GCG	2	6	59134	59139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109003
1057	NC_011990	TTC	2	6	59160	59165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109003
1058	NC_011990	AGA	2	6	59202	59207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109003
1059	NC_011990	CAT	2	6	59290	59295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109003
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1061	NC_011990	CGA	2	6	59400	59405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109003
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1063	NC_011990	CGG	2	6	59480	59485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109003
1064	NC_011990	CCCG	2	8	59537	59544	0 %	0 %	25 %	75 %	222109003
1065	NC_011990	GCCGGC	2	12	59567	59578	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
1066	NC_011990	GAT	2	6	59587	59592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109003
1067	NC_011990	CGG	2	6	59638	59643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109003
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1072	NC_011990	GGCG	2	8	59887	59894	0 %	0 %	75 %	25 %	222109003
1073	NC_011990	ATG	2	6	60027	60032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109003
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1087	NC_011990	CGA	2	6	61018	61023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109003
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1089	NC_011990	CG	3	6	61045	61050	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
1090	NC_011990	GCCC	2	8	61168	61175	0 %	0 %	25 %	75 %	222109003
1091	NC_011990	GCA	2	6	61292	61297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109003
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1095	NC_011990	CG	4	8	61456	61463	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
1096	NC_011990	GAAG	2	8	61528	61535	50 %	0 %	50 %	0 %	222109003
1097	NC_011990	CGC	2	6	61567	61572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109003
1098	NC_011990	TGA	2	6	61641	61646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109003
1099	NC_011990	CGG	2	6	61657	61662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109004
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1101	NC_011990	CGC	2	6	61698	61703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109004
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1104	NC_011990	CGAG	2	8	61751	61758	25 %	0 %	50 %	25 %	222109004
1105	NC_011990	CCG	2	6	61831	61836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109004
1106	NC_011990	GGC	2	6	61923	61928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109004
1107	NC_011990	ATCG	2	8	61992	61999	25 %	25 %	25 %	25 %	222109004
1108	NC_011990	CGAG	2	8	62002	62009	25 %	0 %	50 %	25 %	222109004
1109	NC_011990	CCTG	2	8	62190	62197	0 %	25 %	25 %	50 %	222109005
1110	NC_011990	CGC	2	6	62203	62208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109005
1111	NC_011990	TGT	2	6	62268	62273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109005
1112	NC_011990	CGG	2	6	62310	62315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109005
1113	NC_011990	GCC	2	6	62342	62347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109005
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1115	NC_011990	GCT	2	6	62420	62425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1116	NC_011990	GCG	2	6	62450	62455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109005
1117	NC_011990	AATGGC	2	12	62506	62517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222109005
1118	NC_011990	GC	3	6	62519	62524	0 %	0 %	50 %	50 %	222109005
1119	NC_011990	GGC	3	9	62530	62538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109005
1120	NC_011990	GCC	2	6	62554	62559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109005
1121	NC_011990	GGGATG	2	12	62614	62625	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222109005
1122	NC_011990	GAT	2	6	62659	62664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109005
1123	NC_011990	GC	3	6	62842	62847	0 %	0 %	50 %	50 %	222109005
1124	NC_011990	GGC	2	6	62848	62853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109005
1125	NC_011990	TCG	2	6	62871	62876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1126	NC_011990	GA	3	6	62918	62923	50 %	0 %	50 %	0 %	222109005
1127	NC_011990	GGC	2	6	62990	62995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109005
1128	NC_011990	AGC	2	6	63189	63194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1129	NC_011990	TCC	2	6	63195	63200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109005
1130	NC_011990	TGC	2	6	63222	63227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1131	NC_011990	TCG	2	6	63243	63248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1132	NC_011990	ATGG	2	8	63258	63265	25 %	25 %	50 %	0 %	222109005
1133	NC_011990	AAC	2	6	63277	63282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109005
1134	NC_011990	TCG	2	6	63285	63290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
1135	NC_011990	CGT	2	6	63340	63345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109005
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1139	NC_011990	CGT	2	6	63503	63508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109006
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1142	NC_011990	GGCAC	2	10	63678	63687	20 %	0 %	40 %	40 %	222109006
1143	NC_011990	GAAG	2	8	63740	63747	50 %	0 %	50 %	0 %	222109006
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1152	NC_011990	TCG	2	6	64099	64104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109007
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1159	NC_011990	C	6	6	64574	64579	0 %	0 %	0 %	100 %	222109007
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1165	NC_011990	AAG	2	6	64782	64787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109007
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1201	NC_011990	CGT	2	6	66552	66557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109009
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1219	NC_011990	TCGCC	2	10	67700	67709	0 %	20 %	20 %	60 %	222109011
1220	NC_011990	ACGA	2	8	67722	67729	50 %	0 %	25 %	25 %	222109011
1221	NC_011990	TC	3	6	67746	67751	0 %	50 %	0 %	50 %	222109011
1222	NC_011990	GCGAAG	2	12	67790	67801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222109011
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1227	NC_011990	ATT	2	6	68215	68220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109011
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1231	NC_011990	ATC	2	6	68267	68272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109011
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1233	NC_011990	AG	3	6	68380	68385	50 %	0 %	50 %	0 %	222109011
1234	NC_011990	ATC	2	6	68398	68403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109011
1235	NC_011990	GAC	2	6	68488	68493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109011
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1238	NC_011990	GCC	2	6	68553	68558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109011
1239	NC_011990	TTC	2	6	68584	68589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109011
1240	NC_011990	CTG	2	6	68686	68691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109011
1241	NC_011990	ATG	2	6	68790	68795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109012
1242	NC_011990	GC	3	6	68903	68908	0 %	0 %	50 %	50 %	222109012
1243	NC_011990	TCGA	2	8	68952	68959	25 %	25 %	25 %	25 %	222109012
1244	NC_011990	GGC	2	6	68970	68975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109012
1245	NC_011990	CCAG	2	8	69011	69018	25 %	0 %	25 %	50 %	222109012
1246	NC_011990	TGAC	2	8	69052	69059	25 %	25 %	25 %	25 %	222109012
1247	NC_011990	GGC	2	6	69072	69077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109012
1248	NC_011990	GCG	2	6	69145	69150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109012
1249	NC_011990	GCG	2	6	69156	69161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109012
1250	NC_011990	ACCTCG	2	12	69174	69185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222109012
1251	NC_011990	GC	3	6	69195	69200	0 %	0 %	50 %	50 %	222109012
1252	NC_011990	GGA	2	6	69293	69298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109012
1253	NC_011990	GTG	2	6	69325	69330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109012
1254	NC_011990	ACC	2	6	69364	69369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109012
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1257	NC_011990	CGAT	2	8	69455	69462	25 %	25 %	25 %	25 %	222109012
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1259	NC_011990	GTT	2	6	69501	69506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109012
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